运输手续办理流程会因具体的运输类型（如危险品运输、普通货物运输等）和地区规定而有所不同。以下提供两个具体的例子来说明不同类型的运输手续办理流程。
一、省际危险品船运输经营许可办理流程
实施主体：中华人民共和国交通运输部
办理形式：一般通过在线政务服务平台进行办理。
办理流程：
申请：提交包括申请书、企业法人资格材料、海务机务管理人员资历材料、船舶相关证书（如所有权证书、国籍证书等）、与申请人直接订立的高级船员劳动合同等材料。
受理：交通运输部收到申请材料后，会进行审查，决定是否受理。如果材料不齐全或不符合要求，会一次性告知需要补正的内容。
审查：对提交的材料进行实质性审查，评估申请人的资质和条件是否满足运输经营许可的要求。
决定：根据审查结果，交通运输部会作出是否批准的决定。如果批准，将颁发运输经营许可证书；如果不批准，会书面通知申请人并说明理由。
制证与送达：完成制证后，申请人可以通过指定方式领取许可证书。
办结时限：承诺办结时限为10个工作日，法定办结时限为20个工作日。
二、货物运输车辆道路运输证办理（过户）流程
（以雅安市雨城区为例）
实施主体：雅安市雨城区交通运输局
办理形式：窗口办理或网上办理。
办理流程：
申请：申请人需携带道路运输经营许可证（货运）原件、经办人委托书及身份证明原件、车辆转籍过户申请表原件等材料到政务服务中心综合窗口提交申请。
受理：窗口工作人员收到申请材料后，会当场或规定工作日内作出受理或不予受理决定。如果材料不齐全或不符合要求，会一次性告知需要补正的内容。
审查：办理人员对提交的材料进行审查，评估车辆是否符合过户和继续从事道路运输经营的条件。
决定：根据审查结果，交通运输局会作出是否批准的决定。如果批准，将核发新的道路运输证；如果不批准，会书面通知申请人并说明理由。
制证与送达：完成制证后，申请人可以凭个人身份证明和受理通知书到申办窗口领取新的道路运输证。
办结时限：承诺办结时限为3个工作日，法定办结时限为10个工作日。
综上所述，运输手续办理流程涉及多个环节和步骤，申请人需要按照相关规定和要求准备齐全的材料，并按照流程逐步进行办理。同时，不同地区和不同类型的运输手续办理流程可能会有所差异，因此建议申请人在办理前仔细了解当地的相关规定和要求。