申请门特后，住院报销确实可能会有一些变化，这主要取决于您所在地的具体医保政策。以无锡市为例，我可以给您详细解释一下。

在无锡市，门诊特殊病（简称“门特”）是指那些诊断明确、病情相对稳定、费用负担相对较重，且适合在门诊治疗、比住院更方便的疾病。从2023年1月1日起，无锡市对门诊特殊病政策进行了调整，扩大了门诊特殊病的病种范围，并提高了保障水平。

对于纳入门特保障范围的医疗费用，无锡市医保政策规定不设起付标准，合规医疗费用的医保基金支付比例根据参保人员的身份（如职工医保在职人员、退休人员或居民医保参保人员）有所不同。同时，门特和住院是共用职工医保或居民医保统筹基金年度医疗费用支付限额的。

这意味着，如果您申请了门特并得到了认定，那么在门诊治疗这些特殊病种时，您可以享受到更高的报销比例，而且这部分费用会与您住院的费用共同计算在年度医疗费用支付限额内。因此，从某种程度上说，申请门特后可能会影响到您住院报销的额度，因为两者的费用是合并计算的。

但是，具体的报销比例、限额以及政策细节可能会因地区而异。所以，我建议您最好直接联系您所在地的医保中心或相关定点医疗机构，以了解当地的门特政策和报销规定。这样，您可以更准确地了解自己的权益，并做出合理的医疗选择。