当电动自行车与机动车发生碰撞，且电动自行车方负主要责任时，赔偿流程涉及多个方面。以下是对此情况赔偿问题的详细解答：

一、赔偿责任比例

在电动自行车主责的情况下，赔偿责任比例通常根据事故责任和地区法律规定确定。一般来说，电动自行车一方可能需要承担70%~90%的赔偿责任，而机动车一方则承担剩余的10%~30%。具体比例应由交通管理部门或法院根据事故具体情况进行裁定。

二、赔偿项目及标准

赔偿项目主要分为人身损害赔偿和财产损失赔偿两大类。

1. 人身损害赔偿：

   • 医疗费：根据实际发生的医疗费用计算，需提供相关医疗凭证，如医院发票、诊断证明等。
   • 误工费：根据受害者的收入情况计算，有固定收入的按实际减少收入计算，无固定收入的参照最近三年平均收入或当地相同行业平均工资计算。
   • 护理费：根据护理人员收入或当地护工劳务报酬标准计算。
   • 其他费用：如交通费、住宿费、住院伙食补助费、营养费等，根据实际发生情况并结合医疗机构意见确定。

2. 财产损失赔偿：

   • 机动车维修费用：以实际发生的合理维修费用为准，需提供维修发票等证明。
   • 车辆贬值损失（如有）：对于新车或短年限车辆受损严重时，可主张贬值损失，但需提供相关评估报告。
   • 其他财产损失：如车上物品损坏等，按实际损失赔偿。

三、赔付流程

1. 报警并保护现场：事故发生后应立即报警，等待交警处理并出具事故认定书，这是后续赔偿的重要依据。

2. 交强险赔付：

   • 机动车的交强险会首先在责任限额内进行赔偿，不考虑责任比重。交强险的赔偿限额通常包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。

3. 超出交强险部分的赔付：

   • 超出交强险限额的部分，根据事故责任比例进行分担。电动自行车方需承担主要部分的赔偿责任，可用个人财产进行赔偿。
   • 若电动自行车方购买了相关商业保险（如第三者责任险），则保险公司会按照合同约定进行赔付。

4. 协商与诉讼：

   • 双方可先行协商赔偿事宜，若能达成一致，则可签订赔偿协议并履行。
   • 若协商不成，机动车一方或电动自行车一方可向法院提起诉讼，由法院根据实际情况和证据判定赔偿金额。

四、注意事项

1. 保留证据：事故发生后应保留好所有相关证据，如现场照片、录像、医疗凭证、维修发票等。
2. 及时报案：机动车方应及时向保险公司报案，并说明事故详情。
3. 配合调查：双方应积极配合交警部门和保险公司的调查工作。
4. 履行赔偿义务：一旦赔偿金额确定，电动自行车方应按时履行赔偿义务，避免产生不必要的法律纠纷。

综上所述，当电动自行车与机动车发生碰撞且电动自行车方负主要责任时，赔偿问题涉及多个方面和流程。双方应充分了解自身权益和责任，并遵循相关法律法规和程序进行处理。