您好，对于“检查CT是职工医保直接用医保卡扣吗”这个问题，我可以给您一个详细且清晰的解答。

首先，根据职工医保门诊共济改革的相关规定，参保职工在门诊就医时，除了医保目录内的药品费用可以报销外，符合规定的检查、检验、治疗等费用也是可以报销的。这其中包括了如CT、彩超、核磁共振等门诊检查项目。

当您需要进行CT检查时，如果选择在门诊定点医疗机构进行，您可以持医保卡或者医保电子凭证进行就医结算。在结算过程中，不需要您额外申请报销，系统会自动计算并扣除超过起付线（也称为门槛费）的费用，您只需支付个人应承担的部分。

关于起付线，它是参保人在享受医疗费用报销之前需要自己先支付的费用。门诊统筹起付标准在自然年度内是累计计算的，也就是说，从每年1月1日至12月31日，您在各级医院门诊就诊的费用都会累计计算。只要达到对应级别医院年度门槛费以上的费用，医保统筹基金就会开始报销。

总的来说，进行CT检查时，如果您的费用超过了起付线，并且是在门诊定点医疗机构进行的，那么您可以直接使用医保卡进行结算，系统会自动扣除报销部分，您只需支付剩余的个人费用。

希望这个解答能够帮到您，如果还有其他问题，欢迎随时咨询。