如果在申报个税时没有填写真实的婚姻信息，您需要根据实际情况进行更正或补充填写。以下是一些具体的建议来帮助您处理这个问题：

首先，您需要明确是否已经在个人所得税APP或自然人电子税务局系统中填写了相关信息。如果您已经通过个人所得税APP自行采集了专项附加扣除信息，并且其中包含了婚姻状况，那么您需要确保这些信息是准确无误的。如果您的婚姻状况发生了变化，或者之前填写的信息有误，您需要及时在APP中进行更正。

如果您是通过扣缴单位在自然人电子税务局系统中进行信息采集的，您需要联系扣缴单位，并告知他们您的婚姻信息有误或需要补充。扣缴单位可以在系统中对您的信息进行修改或补充，以确保信息的准确性。

具体来说，如果系统提示“婚姻开始时间不能为空”，而您确实选择了有配偶的选项，那么您需要补充填写婚姻开始时间。这通常是因为在选择有配偶时，婚姻开始时间是必填项。您可以通过扣缴单位在自然人电子税务局系统中的【专项附加扣除信息采集】功能进行填写，选择【添加】-【配偶信息】-【新增】，并填写相应的婚姻开始时间。

另外，还需要注意的是，如果您和扣缴单位之间存在重复采集信息的情况，可能会导致信息不一致或冲突。在这种情况下，扣缴单位可以通过自然人电子税务局系统下载更新您的专项附加扣除信息，以确保信息的准确性和一致性。

总之，如果发现申报个税时没有填写真实的婚姻信息，您需要及时进行更正或补充填写。您可以通过个人所得税APP或联系扣缴单位在自然人电子税务局系统中进行修改或补充。确保您的个人信息准确无误是非常重要的，这有助于确保您的税收权益得到保障。