当您遇到申请再审但法院不立案的情况时，可以采取以下步骤来维护您的合法权益：

一、确认再审条件

首先，请仔细核对您的申请是否符合再审的法定条件。再审通常针对的是原判决在认定事实和适用法律上存在明显错误，或者有新的关键证据能够推翻原判决的情况。如果您的申请不符合这些条件，法院不予立案是合理的。

二、要求出具不予立案裁定书

如果您认为自己的申请符合再审条件，但法院却未予立案，您可以要求法院出具不予立案裁定书。这份裁定书将明确说明法院不立案的具体原因，为您后续的申诉或复议提供依据。

三、申请复议

在收到不予立案裁定书后，您可以在规定的期限内（通常为十日）向作出不予立案裁定的法院申请复议。在复议申请中，您需要详细阐述申请复议的理由，并提供相关证据来支持您的观点。复议的目的是让法院重新审查您的立案申请，并有可能改变不予立案的决定。

四、向上一级法院申诉

如果复议申请被驳回，您可以向上一级法院申诉。申诉时，您需要准备完整的申诉材料，包括再审申请书、原审裁判文书以及不予立案裁定书等。申诉材料应严谨细致，充分说明您的申诉理由和依据。同时，您需要在复议决定送达之日起的三十日内提出申诉，以确保您的合法权益得到及时审查。

五、寻求法律监督和救济

如果您认为法院存在不作为或其他违法情形，您可以向相关的司法监督部门反映情况，要求对法院的行为进行调查和处理。这是维护您合法权益的重要途径之一。

六、注意事项

1. 遵循法定程序和期限：申请再审、复议和申诉都需要严格按照法律规定的程序和期限进行。只有遵循法定程序，才能确保您的合法权益得到合法审查。
2. 提供充分材料：在申请再审、复议和申诉过程中，您需要提供充分的新证据和法律依据来支持您的观点。这些材料和证据应真实、有效，并能够证明原判决存在错误或不当之处。
3. 保持沟通：在整个过程中，与法院和相关部门的沟通非常重要。您可以通过电话、邮件或亲自前往法院等方式与相关人员保持联系，及时了解案件进展情况和处理结果。

综上所述，当您遇到申请再审但法院不立案的情况时，应首先确认再审条件是否满足，然后要求出具不予立案裁定书，并依次申请复议、向上一级法院申诉以及寻求法律监督和救济。在整个过程中，请务必遵循法定程序和期限，并提供充分材料和证据来支持您的观点。