楼顶违建无论存在多少年，只要被认定为违法建筑，相关部门都有权要求拆除。

详细分析如下：

1. 违建的法律性质：

   • 违建，即违法建筑，是指违反了《城乡规划法》等相关法律法规的建筑物或构筑物。
   • 这类建筑对城乡规划的实施产生了不良影响，其违法状态并不会因为时间的推移而改变。

2. 查处时效与违建拆除的关系：

   • 虽然《行政处罚法》规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，期限延长至五年），但这一规定主要针对的是行政处罚的时效。
   • 违建的拆除并不完全等同于行政处罚，它更多是对违法状态的纠正。
   • 因此，即便超过了查处时效，只要违建的事实存在且被认定，相关部门依然有权要求拆除。

3. 违建拆除的实际情况：

   • 在实际操作中，相关部门会定期对辖区内的建筑进行巡查和监管。
   • 一旦发现违建，会依法进行调查和认定，并下达相关的法律文书要求拆除或整改。
   • 拆除违建的时间并不固定，取决于违建的发现时间、认定过程以及拆除工作的安排。

4. 法律建议：

   • 建议公众严格遵守相关法律法规，不进行任何形式的违法建设行为。
   • 如果已经存在违章建筑，应尽快与相关部门联系，了解具体的处理方式和要求，并积极配合进行整改或拆除工作，以避免不必要的法律风险和损失。

综上所述，楼顶违建不会因时间的经过而合法化，其拆除与否主要取决于是否违反规划等法律规定。因此，建议公众遵守法律，避免违法建设行为的发生。