在没有结婚证但女方户口已经迁到男方户口本上的情况下，离婚的程序会稍微复杂一些，因为通常离婚登记需要双方持有结婚证。不过，不用担心，以下是一些建议来帮助你处理这种情况：

一、确认婚姻状况

首先，你需要确认你们的婚姻状况在法律上是否得到承认。尽管没有结婚证，但如果你们已经按照当地习俗或宗教仪式举行了婚礼，并且被社区或亲友所公认，那么在某些情况下，这可能被视为事实婚姻。然而，具体的法律认定可能因地区而异，所以最好咨询当地的法律专家或律师以获取确切的信息。

二、补办结婚证或开具婚姻证明

1. 补办结婚证：如果你们确实曾经登记结婚但结婚证遗失或损坏，可以尝试到原婚姻登记机关补办结婚证。这需要提供一些身份证明和可能的婚姻登记记录证明。

2. 开具婚姻证明：如果无法补办结婚证，你们可以到原婚姻登记机关或户籍所在地的民政部门开具婚姻状况证明。这份证明将说明你们的婚姻状况，包括结婚时间、双方身份信息等。

三、协议离婚或诉讼离婚

1. 协议离婚：如果你们双方能够就离婚事宜（如子女抚养、财产分割等）达成一致意见，那么可以选择协议离婚。这需要你们共同到婚姻登记机关提交离婚申请，并提供相关材料（包括婚姻证明、身份证、户口簿等）。在材料齐全且符合法定程序的情况下，婚姻登记机关将颁发离婚证。

2. 诉讼离婚：如果无法就离婚事宜达成一致意见，或者存在其他复杂情况（如一方不同意离婚、财产争议较大等），那么可以选择诉讼离婚。这需要你向法院提起离婚诉讼，并提交相关证据和材料（包括婚姻证明、身份证、起诉状、证据材料等）。法院将依法审理案件，并作出判决。

四、特别注意

• 在没有结婚证的情况下，离婚程序可能会更加复杂和耗时。因此，建议尽早咨询当地的法律专家或律师以获取专业的法律建议和指导。
• 无论选择哪种离婚方式，都需要确保所有相关材料的真实性和完整性。虚假或不全的材料可能导致离婚程序被驳回或延迟。
• 离婚涉及的法律问题较多且复杂，包括财产分割、子女抚养权争夺等。因此，在处理离婚事宜时，建议保持冷静和理性，尽量通过协商或调解的方式解决问题。如果无法协商或调解成功，再寻求法律途径解决争议。