父亲有民事纠纷案底，一般不会直接影响子女。在我国，刑法实行罪责自负、反对株连的原则，父或母承担民事责任的，子女在法律上无需承担任何责任。民事纠纷案底主要涉及的是父亲个人的法律责任，与子女无关。子女无需为父亲的民事责任，如债务、合同纠纷等承担责任，这些不会波及到子女。

然而，尽管法律上没有直接影响，但在社会舆论和道德层面，父亲的民事纠纷案底可能会对子女的声誉和形象产生一定的间接影响。这种影响可能源于社会对家庭成员行为的一种评价和看法，可能会对子女在社交、婚恋等方面带来一定的压力或偏见。

总的来说，父亲有民事纠纷案底在法律上不会直接影响子女，但可能会在社会舆论和道德层面对子女产生一定的间接影响。如果子女因此面临困扰或问题，可以寻求专业的心理咨询或法律援助，以更好地应对和解决问题。