单位犯罪单罚制并不指控单位被告人，而是只处罚单位中的直接负责的主管人员和直接责任人员。

详细解释如下：

在单位犯罪中，通常采用的是两罚制，即既对单位判处罚金，又对单位的直接责任人判刑。然而，在特殊情况下，会采用单罚制，此时仅对单位的直接负责的主管人员和直接责任人员进行处罚，而不会对单位本身处以罚金刑。

这一制度的设计主要是考虑到在某些情况下，单位犯罪可能更多地是由个别直接责任人员的行为所导致，因此只对这些直接责任人员进行处罚，既能够体现法律的公正性，也能够有效地打击和预防单位犯罪。

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