个人所得税确实是在扣除社保等法定扣除项目后，基于应纳税所得额来计算的。以下是详细的解释和分析：

一、政策依据

根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条的规定，居民个人的综合所得，在计算应纳税所得额时，需先减除一系列的项目，这其中包括了费用六万元（即年度基本减除费用，折合每月5000元），以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除。专项扣除中明确包括了居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金。

二、扣除项目详解

1. 社保费用扣除：单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，都可以从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。但需要注意的是，扣除的社保费用应不超过国家规定的标准，这个标准与省级上年平均职工水平及各项社会保险缴费率相关。

2. 其他扣除项：除了社保费用，还有专项附加扣除（如子女教育、继续教育、大病医疗等支出）以及其他依法确定的扣除项目，如符合条件的公益慈善事业捐赠等。

三、计算流程

以某职工为例，假设其每月工资收入为10000元，个人需承担的社保费用为1000元，住房公积金为800元，专项附加扣除为1000元（仅考虑子女教育）。在计算当月应缴纳的个人所得税时，应先进行以下扣除：

• 应纳税所得额 = 月度收入 - 社保 - 住房公积金 - 专项附加扣除 - 基本减除费用（5000元/月）
• 即应纳税所得额 = 10000 - 1000 - 800 - 1000 - 5000 = 2200元

然后，根据个人所得税税率表，查找对应的适用税率和速算扣除数，计算应纳个人所得税额。

四、注意事项

1. 在进行个税计算时，请确保所有扣除项目均符合国家规定，且不超过相应标准。超过标准的部分不得作为个人所得税的扣除项。

2. 个税政策可能会随国家税收政策的调整而发生变化，建议纳税人及时关注税务部门的最新通知和规定，以确保准确理解和应用税收政策。

综上所述，个人所得税是在扣除社保等法定扣除项目后，基于应纳税所得额来进行计算的。这一规定旨在合理减轻纳税人的税收负担，确保税收的公平性和合理性。