如果您发现商铺被人注册了公司，并希望进行注销，可以按照以下步骤操作：
一、确认公司注册信息与收集证据
确认注册信息：
- 首先，需要明确该公司的注册登记机关，这通常是当地的工商行政管理部门（现称为市场监督管理局）。
- 获取公司的基本信息，如法定代表人、股东、注册地址等，这些信息对于后续的注销流程至关重要。
收集关键证据：
- 如果您是商铺的合法所有人，但并未注册该公司，您需要收集证明您身份和商铺所有权的证据，如身份证、房产证或租赁合同等。
- 如果可能，收集证明公司注册存在问题的证据，如冒用您身份的证据、伪造签名的证据等。
二、向工商行政管理部门投诉与申请撤销
提交书面投诉：
- 携带上述证据前往当地市场监督管理局，提交书面投诉材料，详细说明您被冒用身份注册公司的情况。
- 请求市场监督管理部门进行调查核实，并作出撤销公司登记的决定。
报警处理（如涉及刑事犯罪）：
- 如果身份被冒用注册公司涉及刑事犯罪，如诈骗、伪造公文等，您应向当地公安机关报案。
- 公安机关将展开侦查，追究相关责任人的刑事责任，同时侦查结果也可为工商部门撤销公司登记提供有力依据。
三、启动注销程序（在公司登记被撤销或确认违法后）
成立清算组：
- 如果公司已被撤销登记或确认注册违法，您需要组织清算组来清理公司财产、了结公司业务等。
- 清算组需在公司解散事由出现之日起规定时间内（如15日内）成立，并向工商局备案清算组负责人及成员信息。
通知债权人并公告：
- 在公开发行的报纸上刊登注销公告，通知债权人申报债权。
- 公告期通常为45日（或根据当地规定确定）。
办理税务注销：
- 前往公司所在地的税务机关，办理税务注销手续。
- 提交公司近年的财务报表、纳税申报表等资料，结清应纳税款、滞纳金、罚款等。
- 税务机关审核通过后，会出具清税证明。
办理工商注销：
- 携带税务部门出具的清税证明、清算报告、营业执照正副本等材料，前往工商行政管理部门办理工商注销登记。
- 经审核无误后，工商部门会收回营业执照，公司正式注销。
银行账户注销与印章注销：
- 携带工商注销证明、开户许可证等相关文件，到公司的开户银行办理银行账户注销手续。
- 到公安机关指定的印章刻制点，注销公司所有印章。
四、注意事项
- 遵循法律法规：在整个注销过程中，应确保所有手续齐全、合规，以免产生后续法律问题。
- 地区差异：不同地区和行业可能在具体流程和要求上有所差异，您应根据当地规定进行操作。
- 保存证据与资料：妥善保存所有相关证据和资料，以备日后可能的查询或需要。
通过以上步骤，您可以依法维护自身权益，并顺利完成被冒用身份注册公司的注销手续。如果您在注销过程中遇到任何问题或困难，建议咨询当地的市场监督管理局或寻求专业法律帮助。