CT检查费用一般是可以报销农村合作医疗的，但具体报销比例和条件可能因地区和具体政策而异。不过，根据您提供的参考信息，特别提到了PET-CT这一特殊项目，它是自费项目，城乡居民医疗保险（包括农村合作医疗）通常不可以报销。
为了获得更准确的报销信息，我建议您考虑以下几点：
确认CT类型：首先确认您所做的CT是普通CT还是特殊类型的CT（如PET-CT）。普通CT通常是可以报销的，但特殊类型的CT可能不在报销范围内。
查询当地政策：由于农村合作医疗的报销政策可能因地区而异，我建议您直接咨询您所在地的农村合作医疗管理部门或相关机构，以获取最准确的报销信息。
准备报销材料：如果您确定CT检查费用可以报销，那么请确保妥善保管好所有相关的医疗费用票据、诊断证明和报销申请表等材料。这些材料在申请报销时将是必不可少的。
关注报销流程：了解并遵循当地的报销流程也是非常重要的。您可以通过咨询当地医保部门或查阅相关官方网站来获取详细的报销流程指南。
综上所述，虽然CT检查费用一般是可以报销农村合作医疗的，但具体能否报销以及报销比例和条件还需根据当地的政策和规定来确定。因此，我建议您在申请报销前仔细了解当地的政策和流程，并准备好所有必要的报销材料。