您好，关于违章网上缴费后的扣分问题，我为您详细解释一下相关流程和规定。

首先，当您通过网上渠道（如“交管12123”APP）处理交通违章并缴纳罚款时，扣分是自动进行的。具体扣分情况会根据您违章行为的性质、情节以及相关法律法规来确定。在处理违章时，系统会显示您需要缴纳的罚款金额以及相应的扣分情况。

关于扣分的具体流程，它通常是在您完成违章处理并缴纳罚款后，由交通管理部门根据违章记录自动在您的驾驶证上进行扣分。您不需要额外操作或提交任何材料来执行扣分。

需要注意的是，如果您的驾驶证在违章处理后即将或已经记满12分，那么您将无法再通过网上渠道处理新的违章记录。此时，您需要前往交通管理部门进行线下处理，并可能需要参加相关的交通安全教育或考试。

此外，对于某些严重的违章行为，如酒驾、醉驾、超速行驶等，除了扣分和罚款外，还可能面临其他更严厉的处罚措施，如暂扣驾驶证、吊销驾驶证等。

因此，我建议您在驾驶过程中严格遵守交通规则，确保行车安全，避免产生违章记录。如果确实发生了违章行为，也请尽快通过正规渠道进行处理，以免影响您的驾驶证使用和行车安全。