当夫妻离婚且有两个孩子时，孩子的抚养权判决是一个复杂而细致的过程，法院会综合考虑多个因素来做出最有利于孩子的决定。以下是对这一问题的详细解答：

一、年龄因素

1. 两周岁以下的孩子：

   • 原则上，两周岁以下的孩子会判给母亲抚养，因为这一阶段的孩子对母亲的依赖较大，母亲也更能提供细致的照顾。
   • 但如果母亲存在严重疾病、不尽抚养义务或其他特殊情形，如患有久治不愈的传染性疾病、有抚养条件却不尽抚养义务等，法院可能会判给父亲抚养。

2. 两周岁以上的孩子：

   • 对于两周岁以上的孩子，法院会综合考虑父母双方的抚养能力、抚养条件以及孩子的实际需要，按照最有利于未成年子女的原则进行判决。
   • 这可能包括考虑父母的经济收入、居住环境、教育背景、健康状况等多方面因素。

3. 八周岁以上的孩子：

   • 对于八周岁以上的孩子，法院会尊重其真实意愿，即孩子愿意跟随哪一方生活，法院会重点考虑这一因素。

二、其他影响因素

1. 经济收入：

   • 经济状况较好的一方在争取抚养权时可能更具优势，因为能够为孩子提供更好的物质生活条件和教育资源。

2. 居住环境：

   • 稳定的居住环境对孩子的成长至关重要，因此法院会考虑哪一方能提供更为稳定和适宜的居住环境。

3. 文化程度和品德修养：

   • 父母双方的文化程度和品德修养也会被纳入考量范围，如文化程度高的一方可能在教育孩子方面有一定优势。

4. 健康状况：

   • 父母的健康状况，包括身体和心理健康状况，也是法院考虑的重要因素之一。

三、特殊情况

• 在某些特殊情况下，如男方存在家暴行为，这会对抚养权的判决产生重大影响。法院会倾向于将孩子判给女方，以保障孩子在健康、安全的环境中成长。

四、法律原则

• 根据《民法典》的相关规定，父母与子女间的关系不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或母直接抚养，仍是父母双方的子女，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
• 法院在判决抚养权时，会遵循最有利于未成年子女的原则，综合考虑各种因素，以确保孩子的健康成长。

综上所述，当夫妻离婚且有两个孩子时，法院会根据孩子的年龄、父母双方的抚养能力、抚养条件以及孩子的实际需要等多方面因素来综合判断抚养权的归属。在这一过程中，法院会遵循法律原则，确保孩子的最佳利益得到保障。