农村楼顶阳光房是否算违章建筑，需根据具体情况综合判断。
违章建筑的认定标准：
- 未取得建设工程规划许可证：根据《城乡规划法》，在城市、镇规划区内进行建筑建设需申请建设工程规划许可证。若农村楼顶阳光房的搭建未经此许可，可能构成违法建设，被视为违章建筑。
- 违反规划设计要求：若阳光房的建设超出了原建筑设计的允许范围，如改变承重结构、增加过大荷载等，破坏了建筑的整体安全性或规划布局，也可能被认定为违章建筑。
- 影响公共利益或他人合法权益：若阳光房的搭建妨碍了其他业主的权益，如通风、采光等，或占用了公共空间，损害了公共利益，同样可能被认定为违章建筑。
非违章建筑的判定条件：
- 符合相关规定和要求：若业主在搭建阳光房前已按规定向相关部门提出申请，并获得了必要的审批文件，且阳光房的建设严格按照审批内容进行，未违反规划设计要求，同时不影响建筑安全、公共利益和他人合法权益，则该阳光房不属于违章建筑。
- 地方特殊规定：部分地方政府可能根据当地实际情况，对楼顶搭建有特殊规定或豁免政策。若阳光房符合这些特殊规定，也可能不被视为违章建筑。
农村地区的特殊情况：
- 在农村地区，由于规划和管理的相对宽松，阳光房的搭建可能不像城市那样严格受限。但即便如此，业主仍需遵守当地的法律法规和建设规定，确保阳光房的合法性和安全性。
综上所述，农村楼顶阳光房是否算违章建筑，需根据具体的法律法规、建设规定以及实际情况进行综合判断。若业主对阳光房的合法性存在疑问，建议及时咨询当地相关部门或专业律师（如我），以确保自身权益得到妥善保护。