小规模微型企业在进行报税时，主要需要申报的税种包括增值税及其附加税费。具体来说：

一、主要税种

1. 增值税：小规模纳税人需要根据其应税销售额来申报增值税。对于年应税销售额未超过500万元（含500万元）的企业，或者符合特定条件（如非企业性单位、不经常发生应税行为的企业等）的纳税人，可以按照小规模纳税人的标准进行增值税申报。

2. 附加税费：在进行增值税申报的同时，小规模纳税人还需要申报城市维护建设税、教育费附加以及地方教育附加。这些附加税费是基于增值税的税额来计算的。

二、申报流程

小规模纳税人的申报流程通常包括以下几个步骤：

1. 确定申报模式：系统会根据纳税人的业务复杂程度和身份特征，自动匹配确认式申报或填表式申报模式。

   • 确认式申报：适用于业务简单的纳税人。系统会根据开票数据自动预填部分数据，纳税人只需对预填的数据进行确认，如有未开票收入，则需进行补录。
   • 填表式申报：适用于业务相对复杂的纳税人。纳税人需要直接填写申报表表单，系统会根据企业开具的发票信息自动预填部分数据，纳税人可以根据实际情况进行调整。

2. 填写申报表：在选定的申报模式下，纳税人需要按照要求填写申报表，包括增值税申报表及其附列资料，以及附加税费申报表等。

3. 提交申报：填写完成后，纳税人需要提交申报表。在提交前，建议仔细核对各项数据，确保准确无误。提交后，系统会对申报数据进行校验，如有错误或异常，系统会给出提示，纳税人需要根据提示进行修改或更正。

4. 缴纳税费：申报成功后，纳税人需要按照系统提示的应缴税额进行缴纳。可以通过电子税务局的在线缴款功能进行缴纳，也可以到指定的银行或税务窗口进行缴纳。

三、注意事项

1. 定期定额户：对于定期定额户纳税人，系统会根据核定的税额自动展示定期定额户纳税人适用页面。如本期超定额，则需通过相应的功能模块进行自行申报缴纳。

2. 减免政策：如果纳税人享受特定的税收减免政策，需要在申报时选择相应的减免性质代码及名称，并输入对应的减免税额信息。

3. 申报期限：小规模纳税人需要按照规定的纳税期限进行申报和缴纳税费。建议提前了解并关注相关的申报期限和缴纳要求，以免错过申报时间或产生滞纳金等不必要的费用。

综上所述，小规模微型企业在报税时需要主要关注增值税及其附加税费的申报。通过了解申报流程、注意事项以及相关的减免政策等信息，可以帮助企业更好地完成报税工作。