国有公司企业人员滥用职权罪的立案标准，主要依据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》来确定。具体来说，该罪名涉及以下几种立案情形：
造成国家直接经济损失：
- 滥用职权行为导致国家直接经济损失数额达到三十万元以上。这里的“直接经济损失”指的是因滥用职权行为直接造成的国家财产损毁或减少的实际价值，不包括间接经济损失。
造成单位破产、停业、停产等严重后果：
- 滥用职权行为导致有关单位破产，或者停业、停产六个月以上，或者被吊销许可证和营业执照、责令关闭、撤销、解散。这些后果对单位和国家利益造成了严重影响，因此属于立案标准之一。
其他致使国家利益遭受重大损失的情形：
- 这是一个兜底性规定，用于涵盖那些虽未明确列举，但实际上因滥用职权行为导致国家利益遭受重大损失的情况。例如，滥用职权导致企业重要科研项目失败、大量国有资产流失等。
在适用这些立案标准时，需要注意以下几点：
- 直接经济损失的计算必须准确，确保数据的真实性和准确性，避免因计算错误而导致立案不当。
- 因果关系的判断至关重要，需要查明滥用职权行为与造成的后果之间是否存在直接的因果关系，以确保立案的合理性。
- 对于兜底性规定的适用，应根据案件的具体情况进行综合评定，确保立案标准的准确性和公正性。
一旦符合上述立案标准之一，就应当对国有公司企业人员的滥用职权行为进行立案追诉，并依法追究相关人员的刑事责任。根据《刑法》的相关规定，滥用职权罪虽未明确提及具体刑罚，但根据其性质和后果的严重性，可参照国有公司、企业人员失职罪的规定进行处罚，即可能面临三年以下有期徒刑或者拘役的刑罚，如果致使国家利益遭受特别重大损失，还可能面临更重的刑罚。