机关单位在确定保密要害部门、部位时，应当坚持以下原则：

1. 最小化原则：机关单位应精准识别并严格控制保密要害部门、部位的数量和范围。具体来说，应将涉及绝密级或者较多机密级、秘密级国家秘密的机构确定为保密要害部门；将集中制作、存放、保管国家秘密载体的专门场所确定为保密要害部位。这一原则的核心在于“精确识别”，避免不必要的扩大化，以集中资源和精力对真正的保密要害进行重点保护和管理。

2. 最大化防范原则（分级确定原则）：对于被确定为保密要害部门、部位的区域，机关单位应采取最严格的防范措施和手段，确保其安全可控。这包括物理防护、技术防护以及人员管理等多个方面。同时，根据工作中涉及国家秘密的密级高低和数量多少，对保密要害部门、部位实行分级管理，不同级别的保密要害部门、部位在人员配备、安全防护措施、监督管理等方面应采取不同程度的保密保障措施。

综上所述，机关单位在确定保密要害部门、部位时，应综合考虑最小化原则和最大化防范原则，通过精确识别、分级管理和严格防范等措施，实现国家秘密保护的最优化。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问，我会尽力为您提供帮助。