关于电动车闯红灯被撞后保险公司是否会赔偿的问题，这确实是一个涉及多个因素的复杂情况。以下是对这一问题的详细解答：
一、交强险的赔偿责任
首先，根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及《道路交通安全法》的相关规定，无论电动车是否被认定为机动车，只要它发生了交通事故并造成了除本车人员和被保险人以外的人员伤亡或财产损失，保险公司都应在机动车交通事故责任强制保险（交强险）责任限额范围内予以赔偿。这意味着，即使电动车一方闯红灯，保险公司在交强险范围内仍需承担赔偿责任。交强险的赔偿限额通常包括死亡伤残赔偿、医疗费用赔偿以及财产损失赔偿，具体数额根据有责或无责情况而定。
二、商业险的赔偿与免责
电动车被认定为机动车且投保商业险：
- 在这种情况下，商业保险合同会对被保险人的责任和义务进行明确约定。如果电动车闯红灯导致事故，且保险合同中未明确将此行为列为免责事由，保险公司应按合同约定进行赔偿。然而，由于闯红灯是违法行为，保险公司可能会因此增加免赔率或拒绝部分赔偿。
- 如果保险合同中明确规定因违反交通法规导致事故可免赔或拒赔，那么保险公司将依据此条款执行。此外，如果驾驶人存在未取得驾驶资格、醉酒驾驶等严重违法行为，保险公司也将免责。
电动车未被认定为机动车：
- 对于未被认定为机动车的电动车，它们通常不会投保传统的机动车商业险。但如果车主购买了针对非机动车的意外险等保险产品，并且事故符合这些保险的理赔范围，那么保险公司会按照合同约定进行赔偿。否则，保险公司将不会承担赔偿责任。
三、实际赔偿流程与注意事项
- 事故责任认定：在发生交通事故后，首先应由交警部门对事故责任进行认定。这是后续保险赔偿的重要依据。
- 保险赔偿：根据事故责任认定书和保险合同条款，保险公司会在交强险责任限额内对受害人进行赔偿。对于超出交强险责任限额的部分，则需按事故责任比例由电动车驾驶人等责任方承担。如果电动车驾驶人投保了商业险且符合赔偿条件，那么商业险也会按照合同约定进行赔偿。
- 遵守交规与阅读保险条款：为了避免因违法行为带来的经济损失和保险纠纷，电动车车主应严格遵守交通规则并仔细阅读保险条款。在购买保险时，应了解清楚保险条款内容特别是赔偿范围和免责情况以便在需要时能够顺利获得赔偿。
综上所述，电动车闯红灯被撞后保险公司的赔偿情况取决于多种因素包括事故具体情况、电动车性质、所投保险种及保险合同条款等。因此建议电动车车主在购买保险时务必了解清楚保险条款内容并在行驶过程中严格遵守交通规则以降低潜在的经济风险。